Ruta 40-41
Éstan serán las dos primeras rutas marinas que visites en el juego. Para llegar a ellas, sal por el oeste de Ciudad Olivo y usa la MO Surf para ponerte sobre el agua. Ahora, sigue el camino por el mar. La Ruta 40 es más corta que la Ruta 41, pues sólo tiene a cuatro entrenadores, aunque en ella puedes conseguir la MT88 Picoteo, en el terreno que aparece en la segunda imagen. Una vez hayas derrotado a todos los entrenadores, llegarás enseguida a la Ruta 41.
| Entrenador | 1º Pokémon | 2º Pokémon | 3º Pokémon |
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| Nadador | Tentacool Nv.20 | Tentacool Nv.20 | |
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| Nadadora | Staryu Nv.21 | ||
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| Nadador | Shellder Nv.18 | Shellder Nv.18 | Wartortle Nv.20 |
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| Nadadora | Staryu Nv.19 | Shellder Nv.19 |
A diferencia de la anterior, la Ruta 41 no tiene ningún objeto por conseguir, aunque rodea a cuatro islas, las Islas Remolino, a las que sólo podremos acceder cuando tengamos la MO Torbellino y más medallas. En esta Ruta tendremos un total de 10 entrenadores, así que se hará más larga. Una vez los hayas derrotado a todos, sigue a la izquierda y llegarás a Ciudad Orquídea.
| Entrenador | 1º Pokémon | 2º Pokémon | 3º Pokémon | 4º Pokémon | 5º Pokémon | 6º Pokémon |
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| Nadador | Tentacool Nv.16 | Tentacool Nv.16 | Tentacool Nv.17 | Tentacool Nv.17 | Remoraid Nv.19 | Staryu Nv.19 |
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| Nadador | Shellder Nv.21 | Tentacool Nv.19 | Tentacruel Nv.19 | |||
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| Nadadora | Goldeen Nv.18 | Goldeen Nv.20 | Seaking Nv.20 | |||
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| Nadador | Krabby Nv.23 | |||||
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| Nadador | Qwilfish Nv.23 | |||||
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| Nadadora | Horsea Nv.21 | Horsea Nv.21 | ||||
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| Nadadora | Staryu Nv.20 | Starmie Nv.20 | ||||
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| Nadadora | Psyduck Nv.20 | Goldeen Nv.22 | ||||
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| Nadador | Gyarados Nv.20 | Gyarados Nv.20 | ||||
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| Nadadora | Seel Nv.22 |